<button id="btn">Start script</button>

btn.onclick= e=>{
  let arr = [];
  let i = 3;

  while (i--){
      arr[i]= prompt('Введите название города');
  }

  let nativeCity= prompt('Введите название родного города')  

  if(arr.includes(nativeCity)){
    alert('Я знаю твой родной город')
  } else {
    alert('Я НЕ знаю твой родной город')
  }
}